Материалы по тегу: рск

20.03.2023 [12:42], Сергей Карасёв

Российский суперкомпьютер помог создать более быстрый тест на COVID-19

Российские исследователи совместно с коллегами из Канады сообщили о разработке метода, который позволяет практически на порядок сократить время выявления частиц COVID-19 в слюне человека по сравнению с широко распространённым тестом ПЦР.

В работах приняли участие специалисты из Федерального исследовательского центра «Красноярский научный центр СО РАН» (ФИЦ КНЦ СО РАН), Красноярского государственного медицинского университета имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого (КрасГМУ) и Сибирского федерального университета (СФУ).

Учёные смоделировали короткие нуклеотидные последовательности — аптамеры. Они специфично связываются с одним из самых редко мутирующих белков вируса, благодаря чему со 100-% точностью выявляют его уханьский вариант, а также штаммы «Омикрон» и «Дельта». Предложенный подход даёт возможность ускорить выявление коронавируса практически в десять раз, а также удешевить процедуру. Кроме того, медики смогут выявлять заболевание на самых ранних стадиях.

 Источник изображения: РСК

Источник изображения: РСК

«Исследователи с помощью технологии эволюции ДНК в пробирке создали короткие последовательности ДНК и проследили за взаимодействием с N-белком коронавируса, составляющим основу его оболочки. В отличие от S-белка, используемого SARS-CoV-2 для проникновения в человеческие клетки, устройство N-белка почти не меняется, что позволяет использовать его в качестве опознавательного знака всех существующих штаммов коронавируса», — отмечается в публикации.

В ходе выполнения работ исследователи задействовали более 1700 вычислительных узло-часов из ресурсов Межведомственного суперкомпьютерного центра Российской академии наук (МСЦ РАН). Эта HPC-платформа состоит из нескольких энергоэффективных и высокоплотных вычислительных систем на базе серверов с жидкостным охлаждением. Они спроектированы и установлены в МСЦ РАН специалистами группы компаний РСК.

Исследование поддержано грантом Президентской программы Российского научного фонда (РНФ). В ходе работ учёным удалось отобрать 16 аптамеров, способных связываться с оболочкой вируса SARS-CoV-2. Самым удачным (по сочетанию двух признаков — силы связывания и избирательности) из них признан tNSP3: он стал основой для новой высокочувствительной системы тестирования на коронавирусную инфекцию. В ходе тестов tNSP3 позволил определить N-белок в количествах, сопоставимых с чувствительностью ПЦР.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1083674
17.11.2022 [15:26], Сергей Карасёв

Во благо науки: производительность российского суперкомпьютера «Говорун» превысила 1 Пфлопс

В Объединённом институте ядерных исследований (ОИЯИ) в Дубне состоялась презентация модернизированного суперкомпьютера «Говорун»: быстродействие системы поднялось практически на четверть (на 23,5 %) и достигло 1,1 Пфлопс.

В ходе нынешнего этапа модернизации, ставшего третьим по счёту, специалисты РСК установили 32 новых вычислительных узла. Каждый из них содержит два 38-ядерных процессора Intel Xeon Platinum 8368Q (2,6 ГГц), 256 Гбайт памяти DDR4 + 2 Тбайт энергонезависимой памяти Intel Optane PMem и четыре NVMe-накопителя EDSFF E1.S суммарным объёмом 16 Тбайт. Кроме того, каждый узел снабжён двумя адаптерами Omni-Path с пропускной способностью 100 Гбит/с.

 Источник изображения: РСК

Источник изображения: РСК

Вычислительный комплекс оборудован полностью жидкостным охлаждением на «горячей воде». Суперкомпьютер использует гиперконвергентную архитектуру, в основе которой лежит подход объединения ресурсов для вычисления и хранения на каждом узле. Это позволяет наиболее эффективно масштабировать общие ресурсы системы с увеличением количества узлов. Заявленная скорость работы файловой системы на чтение/запись информации превышает 300 Гбайт/с.

«Применение жидкостного охлаждения в суперкомпьютере ОИЯИ позволяет не только существенно экономить электроэнергию во время работы вычислительного комплекса (на его охлаждение расходуется менее 3 % электричества, требуемого для функционирования всей системы), но и использовать самые высокопроизводительные серверные процессоры Intel Xeon Platinum 8368Q», — говорится в публикации.

«Говорун» применяется для ускорения комплексных теоретических и экспериментальных исследований в области физики высоких энергий, ядерной физики и физики конденсированных сред, в том числе для реализации мега-проекта NICA по созданию на базе ОИЯИ ускорительного комплекса для воссоздания в лабораторных условиях особого состояния вещества, в котором пребывала Вселенная в первые мгновения после Большого Взрыва — кварк-глюонной плазмы.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1077513
20.10.2022 [16:16], Сергей Карасёв

Компания Selectel проанализировала потребности пользователей Новосибирска в IT-инфраструктуре

Компания Selectel, ведущий российский провайдер IT-инфраструктуры, провела исследование Новосибирска и области в разрезе потребностей и перспектив использования IT-решений в регионе. Анализ выявил потребность бизнеса в ряде сервисов и недостаточную представленность этих услуг на локальном рынке.

В исследовании, проведенном в III квартале 2022 года, Selectel сопоставил данные пяти открытых аналитических отчетов по инновационности региона и выработал собственную оценку перспектив размещения коммерческой IT-инфраструктуры. В сводный рейтинг попали такие показатели, как: уровень инновационного развития регионов, состояние индустрии разработки ПО, затраты на развитие ИКТ и привлекательность города для IT-специалистов. По результатам анализа, Новосибирск занимает четвертое место: опережает область только Москва, Санкт-Петербург и Татарстан / Екатеринбург (делят третье место).

 Источник изображения: Selectel

Источник изображения: Selectel

Аналитики Selectel также выяснили, что Новосибирск входит в топ-5 регионов по запросу на выделенные серверы.

«Мы обратили внимание, что при высоком потенциале региона примерно в половине случаев IaaS-провайдеры предлагают во многом устаревшие конфигурации серверного оборудования, — рассказал Константин Ансимов, директор по развитию инфраструктурных продуктов, Selectel. — Более свежие решения зачастую имеют неоправданно высокую цену в некоторых случаях на 100-200 % выше по сравнению со стоимостью таких же сборок в Москве и Санкт-Петербурге. Поэтому мы видим значительный потенциал для улучшения предложения в интересах клиентов».

Selectel начал инвестировать в развитие облачной платформы в Новосибирске в 2019 году и постепенно наращивает предложение в соответствии с клиентскими запросами. Всего за время существования облака в Новосибирске им воспользовались почти 3000 клиентов. Чтобы удовлетворить потребности пользователей региона, провайдер в сентябре запустил услугу выделенных серверов, которые подойдут как для малого бизнеса и предпринимательства, так и для крупных компаний.

Наиболее популярная причина использования продуктов клиентами в Новосибирске — потребность в дополнительной точке присутствия для стабильного развития бизнеса в Сибирском федеральном округе и ближайшем зарубежье (СНГ). Вторым по полярности сценарием использования IT-решений в регионе является применение инфраструктуры для развития ML и AI.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1076076
22.08.2022 [12:49], Андрей Крупин

МТС развернула модульный ЦОД в Новосибирске

Телекоммуникационная компания «Мобильные ТелеСистемы» (МТС) сообщила о вводе в эксплуатацию нового центра обработки данных в Новосибирске. Вычислительный комплекс построен по модульному принципу, является первым ЦОД МТС данного типа в восточной части России и тринадцатым в федеральной сети дата-центров компании.

Модульный ЦОД отличается от традиционных дата-центров возможностью быстро масштабировать необходимые вычислительные мощности под любые задачи. На первом этапе на площадке задействованы два модуля по 125 стоек полезной мощностью 1,8 МВт. Этого достаточно, чтобы обеспечить работу IT-инфраструктуры МТС: биллинга, системы онлайн-обслуживания абонентов, оборудования для сетей 3G/4G/5G и различных сервисов.

 Источник изображения: mts.ru

Источник изображения: mts.ru

Надёжность модульного ЦОД в Новосибирске подтверждена сертификатом Uptime Institute по уровню отказоустойчивости Tier III в категории Constructed Facility.

В течение года МТС планирует увеличить доступные мощности дата-центра в два раза и использовать их для развития облачных продуктов компании и инфраструктуры #CloudMTS.

В настоящий момент сеть дата-центров МТС состоит из 15 географически распределённых ЦОД, включая новый вычислительный комплекс в Новосибирске. Все они соединены собственной магистральной сетью протяжённостью 248 тыс. км. В четырёх регионах (Москва, Санкт-Петербург, Новосибирск и Владивосток) развёрнута облачная инфраструктура #CloudMTS. Стратегия компании подразумевает также строительство Edge- и Far-Edge-ЦОДов в большинстве регионов страны под задачи бизнеса.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1072638
27.07.2022 [19:00], Сергей Карасёв

СПбПУ и РСК создадут Центр компетенций для разработки новых промышленных решений на базе передовых цифровых технологий

Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого (СПбПУ) и группа компаний РСК подписали меморандум о сотрудничестве. Документ предполагает формирование Центра компетенций для разработки новых промышленных решений с применением передовых цифровых технологий. Меморандум был сформирован во время переговоров, проведенных на выставке «Иннопром 2022».

Сотрудничество будет вестись по нескольким направлениям. В частности, стороны разработают план развития суперкомпьютерных вычислений в СПбПУ в рамках совместных проектов. Предполагается, что развитие ИТ-инфраструктуры университета будет способствовать решению наукоёмких мультидисциплинарных задач в области цифрового инжиниринга.

В СПбПУ располагается суперкомпьютерный центр «Политехнический» — один из самых мощных и наиболее инновационных в России центров высокопроизводительных вычислений (НРС). Технологической основой суперкомпьютерных систем, установленных в центре, является универсальное высокоплотное и энергоэффективное решение «РСК Торнадо» со 100-% жидкостным охлаждением на «горячей воде». Суммарная пиковая производительность систем в настоящее время составляет 1,812 Пфлопс.

 Фото: СПбПУ

Фото: СПбПУ

Отмечается, что использование HPC-систем необходимо для реализации проектов в двигателестроении, авиастроении, энергомашиностроении, нефтегазовом, атомном, тяжёлом и специальном машиностроении, приборостроении, судостроении, автомобилестроении, ракетной и космической техники и др. Основной задачей Центра компетенции будет применение оптимизационных методов для разработки новых промышленных решений с помощью применения передовых отечественных программно-аппаратных комплексов.

«Это, в свою очередь, будет способствовать решению наукоемких задач в области цифрового инжиниринга, разработки цифровых двойников высокотехнологичных изделий промышленности, применению цифровых и производственных технологий, аддитивных технологий, технологий сварки и защитных покрытий, разработанных СПбПУ. Кроме того, Центр компетенции будет заниматься формированием стратегии развития национального технологического суверенитета в области разработки и применения систем автоматизированного проектирования (CAD) и инжиниринга (CAE) с использованием высокопроизводительных вычислений (HPC)», — пояснил Егор Дружинин, технический директор группы компаний РСК.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1070982
12.07.2022 [00:28], Игорь Осколков

Суперкомпьютер в дорогу: РСК показала на Иннопроме обновлённый мобильный ЦОД

Группа компаний РСК, ведущий российский разработчик суперкомпьютеров и систем для высокопроизводительных вычислений (HPC), дата-центров, облачных платформ и систем хранения данных (СХД) показала на выставке Иннопром-2022 обновлённую версию своей платформы для автономных периферийных вычислений, которая позволяет оперативно, в течение часа силами двух человек, развернуть HPC-кластер практически в любом месте.

 «РСК Мобильный ЦОД»

«РСК Мобильный ЦОД»

Решение упаковано в несколько контейнеров (0,7 × 0,7 × 1,1 м), которые можно транспортировать независимо друг от друга и собирать уже на месте. Один контейнер вмещает собственно вычислительную часть, второй — полностью интегрированный модуль распределения теплоносителя с узлом управления, а третий, опциональный — ИБП с инвертором. Дополняет их компактный внешний модуль охлаждения. Вся система имеет весьма солидный запас по возможности отвода тепла — до 60 кВт.

Правда, сейчас столько и не требуется. Вычислительный блок фактически является уменьшенной копией платформы «РСК Торнадо»: 2 колонны по 10 слотов. Поэтому мобильная платформа позволяет совмещать в одной системе серверы «Торнадо» с процессорами x86-64 (AMD EPYC и Intel Xeon) и «Эльбрус» (сейчас 8С/8СВ, в перспективе 16С) с любым уровнем TDP, GPGPU-серверы (по два PCIe-ускорителя на сервер, без ограничений по TDP) и серверы хранения (до 12 × M.2 All-Flash).

В текущем варианте платформы каждый слот рассчитан на 2 кВт тепловой нагрузки (и столько же по питанию), хотя нынешние серверы укладываются в среднем в 700–800 Вт, а серверы следующего поколения потребуют чуть больше 1 кВт. Подсистема питания имеет два домена, по одному на колонну, и требует однофазный ввод AC 230 В/50 Гц, хотя фактически может работать в диапазоне 105–280 В. Запитать систему можно от генератора, а подстраховать — ИБП. Но возможно и специсполнение с поддержкой 48 В DC.

 Сервер «РСК Торнадо» с «Эльбрус-8СВ»

Сервер «РСК Торнадо» с «Эльбрус-8СВ»

Сетевая подсистема может быть представлена ToR-коммутаторами как двойной (на обе колонны) ширины, так и одиночной. В том числе есть варианты с жидкостным охлаждением. Доступен даже InfiniBand — у Mellanox есть коммутаторы в подходящем форм-факторе, рассчитанные на промышленное применение. Также предоставляется 1 GbE-коммутатор для развёртывания служебной сети.

Самая интересная часть — это охлаждение. Как и в «большой» версии платформы здесь используется фирменная СЖО, которая покрывает все компоненты серверов, так что вычислительная часть не требует активного воздушного охлаждения и способна работать даже с закрытыми крышками контейнера. Защиты по какому-либо классу IP в стандартном варианте не предусмотрено, но опять-таки по заказу возможно специсполнение.

СЖО всё так же поддерживает охлаждение горячей водой, причём на всех компонентах температура не превышает +45 °C. Для запуска вычислительного модуля необходимо, чтобы он находился в помещении с плюсовой температурой и чтобы не было образования конденсата. А вот внешний контур охлаждения менее прихотлив и способен работать при температурах от -65 °C. Верхний же предел — не менее +40 °C. Требования по питанию у него те же, что и у серверов.

 «РСК Мобильный ЦОД»

«РСК Мобильный ЦОД»

Узел управления автоматически отслеживает и регулирует параметры всех компонентов системы во время запуска и работы. По умолчанию используется сценарий защиты оборудования, так что при неблагоприятных условиях серверы могут выключаться. Но возможны и другие сценарии, например, «работа до последнего», когда потеря данных оказывается дороже потери оборудования.

Управляется мобильная платформа фирменной системой оркестрации «РСК БазИС», которая позволяет задействовать все возможности компонуемой, программно определяемой инфраструктуры, в том числе для реализации HCI-платформы. «РСК БазИС» предлагает GUI, CLI, открытые API и SDK для интеграции с другими приложениями. Таким образом, заказчик получает полностью интегрированное программно-аппаратное решение, готовое к быстрому развёртыванию и использованию.

Изначально платформа создавалась для нужд добывающего сектора, но этой сферой её возможности не ограничиваются. Она также подходит для научных экспедиций и промышленных предприятий (срочная обработка больших массивов данных), медиасферы и обслуживания массовых мероприятий (рендеринг, стриминг с множества камер) и т.д. В общем, везде, где на время требуется действительно мощная, но компактная и удобная в доставке, развёртывании и эксплуатации вычислительная платформа.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1069873
22.04.2022 [14:48], Алексей Степин

Российский суперкомпьютер «Говорун» получит сверхбыстрое хранилище ёмкостью 8 Пбайт

Суперкомпьютер «Говорун» Объединённого института ядерных исследований (ОИЯИ) — во многом уникальная машина. В частности, она обладает весьма продвинутой подсистемой хранения данных, которая в 2020 была отмечена наградой, а с 2018 года входит в рейтинг IO500. Но объёмы данных для сложных физических моделей постоянно растут, поэтому на днях была начата модернизация суперкомпьютера.

За обновление системы отвечает её разработчик, группа компаний РСК. Суперкомпьютер получит новые узлы хранения Tornado AFS сверхвысокой плотности, которые позволяют разместить 1 Пбайт данных в 1U-шасси, охлаждаемом, как и остальные узлы системы, горячей водой (PUE до 1,04). Tornado AFS вмещает до 32 SSD в форм-факторе EDSFF E1.L, ёмкостью 30 Тбайт каждый.

Модуль RSC Tornado AFS (All Flash). На переднем плане — SSD в формате EDSFF E1.L

На первом этапе будет установлено 8 новых узлов AFS, то есть «Говорун» получит 8 Пбайт для хранения «тёплых» данных. Ожидается, что столь объёмный буфер поможет ускорить решение некоторых задач ОИЯИ в 5–8 раз. Особенно ценным он будет в рамках совместного использования вычислительных ресурсов в сети НИКС, объединяющей ОИЯИ и Межведомственный суперкомпьютерный центр МСЦ РАН.

 DAOS позволяет использовать SSD в совокупности с решениями Intel на базе памяти Optane

DAOS позволяет использовать SSD в совокупности с решениями Intel на базе памяти Optane

Новое хранилище использует открытую, программно определяемую СХД Intel DAOS. Впрочем, в составе комплекса «Говорун» работают и другие сегменты СХД, использующие NFS и Lustre. Гиперконвергентный подход к построению «Говоруна» позволил добиться линейной производительности свыше 300 Гбайт/с при операциях чтения и записи.

«Говорун» занят решением сложнейших физических задач, включая исследования в области квантовой хромодинамики, изучение свойств плотной барионной материи, существовавшей в первые мгновения после Большого Взрыва, расчёты радиационной безопасности экспериментальных установок, исследования в области радиобиологии и т.д.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1064440
30.03.2022 [22:01], Владимир Мироненко

Российская суперкомпьютерная платформа «РСК Торнадо» объединила отечественные «Эльбрусы» и зарубежные x86-процессоры

Группа компаний РСК на конференции «Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ) 2022» сообщила о создании суперкомпьютерной платформы «РСК Торнадо», которая позволяет одновременно использовать в одной системе вычислительные узлы на базе зарубежных x86-процессоров и отечественных чипов «Эльбрус».

Возможность использования различных типов микропроцессорных архитектур в одном монтажном шкафу (до 104 серверов в стойке), позволит ускорить темпы импортозамещения в области высокопроизводительных вычислительных систем (HPC), решений для центров обработки данных (ЦОД) и систем хранения данных (СХД). Унифицированная интероперабельная (т.е. обеспечивающая функциональную совместимость разных решений) платформа «РСК Торнадо» предназначена для решения широкого круга задач, в том числе для работы с нагрузками Big Data, HPC и ИИ.

 Суперкомпьютер «Говорун» в ОИЯИ (Фото: Группа компаний РСК)

Суперкомпьютер «Говорун» в ОИЯИ (Фото: Группа компаний РСК)

Разработка и создание вычислительных систем на основе «РСК Торнадо» осуществляется на территории России в рамках соглашения с Министерством промышленности и торговли Российской Федерации с целью реализации подпрограммы «Развитие производства вычислительной техники» в составе государственной программы «Развитие электронной и радиоэлектронной промышленности».

Программный стек «РСК БазИС» для вышеупомянутой платформы тоже разработан в России. В настоящее время система «РСК БазИС» используется для оркестрации вычислительных мощностей Межведомственного суперкомпьютерного центра (МСЦ) РАН, Санкт-Петербургского политехнического университета (СПбПУ) и Объединенного института ядерных исследований (ОИЯИ), сведённых в единую инфраструктуру для оптимизации вычислительных ресурсов.

Постоянный URL: http://servernews.ru/1063096
Система Orphus