Новый чип ускорит и удешевит расчёты молекулярной динамики

 

Современная вычислительная техника уже достигла того уровня, когда возможна полноценная симуляция поведения молекул вещества. Но такая симуляция требует чудовищных вычислительных мощностей, которые, в свою очередь, влекут за собой чудовищные энергетические затраты, поэтому разработчики постоянно ищут новые пути и предлагают новые архитектуры. Так, специализированные ускорители, разработанные D.E. Shaw Research, успешно работают в суперкомпьютерах серии Anton. Рассматриваются и другие пути, такие, как использование графических ускорителей или даже многоядерных процессоров общего назначения, например, Intel Knights Landing.

Кластер Anton, 512 узлов

Кластер Anton, 512 узлов

В настоящее время ведутся работы по созданию специализированного процессора для расчётов молекулярной динамики, в основе которого будет лежать принцип MapReduce. Разработками занимается группа учёных из Политехнического университета Бухареста (Румыния) и Колледжа Святого Ансельма (США). Сейчас ускорители общего назначения могут справиться с 75 % задач, в частности, с наиболее популярным в этой области пакетом GROMACS, но исследователям удалось ускорить и оставшиеся 25 % с применением нового ускорителя. Прототип смог показать 64-процентную эффективность распараллеливания при расчёте повторяющихся клеточных структур.

Эффективность нового ускорителя впечатляет даже в реализации ПЛИС

Эффективность нового ускорителя впечатляет даже в реализации ПЛИС

Архитектура нового ускорителя, пока реализованного в виде ПЛИС, в целом, схожа с архитектурой чипов Anton, при этом последние являют собой специализированные ASIC, которые лишь в три раза эффективнее ПЛИС-версии новой разработки. Если её также выполнить в виде специализированного чипа с частотой 2,7 ГГц, то производительность окажется выше, а уровень энергопотребления — намного ниже, нежели у решения D.E. Shaw Research. По уровню удельной производительности новинка занимает первое место даже сейчас, а в окончательном варианте выигрыш составит до 300 раз.

Если вы заметили ошибку — выделите ее мышью и нажмите CTRL+ENTER. | Можете написать лучше? Мы всегда рады новым авторам.

Источник:

Постоянный URL: https://servernews.ru/957004

Комментарии

Система Orphus